Het eerste seizoen van New York Police werd met veel lof door critici ontvangen en met talrijke prijzen onderscheiden. De fans stonden dan ook versteld toen bekend werd dat David Caruso de serie aan het begin van het tweede seizoen zou verlaten. Fans en critici wachtten in spanning af of de getalenteerde cast van de serie na Caruso’s vertrek zich staande wist te houden.
NYPD Blue is een televisieserie waarin het fictieve personeel van het 15e district van de New Yorkse politie in beeld wordt gebracht. De spil van NYPD Blue is detective Andy Sipowicz gespeeld door Dennis Franz. Andy is een norse, introverte senior detective met een hart van goud. In de eerste seizoenen is hij een alcoholist die aan lagerwal dreigt te raken. Nadat hij ternauwernood een schietpartij overleeft, lukt het hem om zijn leven te beteren. Later werkt hij zich op tot de steun en toeverlaat van het bureau. In de laatste aflevering heeft hij het zelfs tot chef weten te schoppen.
Trials & Tribulations
Licalsi probeert zijn zaak te bepleiten en krijgt slechts zes jaar gevangenisstraf voor de moord, maar Kelly is fel gekant tegen de afspraak nadat hij beseft dat hij verliefd is op Janice. Als Robin hoort dat Kelly nog steeds gevoelens voor Janice heeft, beëindigt Robin hun relatie. Ondertussen gaan Sipowicz en Kelly op onderzoek naar een appartementencomplex dat het doelwit is geweest van verschillende overvallen.
For Whom the Skell Rolls
Licalsi neemt het standpunt in tijdens haar proces. Het Bureau voor Binnenlandse Zaken doet onderzoek naar Kelly en Sipowicz met betrekking tot de arrestatie van agent Guyce en agent Quint. Ondertussen onderzoeken Kelly, Sipowicz, Medavoy en Martinez de moord op een zwart echtpaar.
Cop Suey
Kelly onderzoekt de dood van een undercoveragent in Chinatown, en daarvoor moet hij de hulp aanvaarden van een prominente Chinese bendeleider. Ondertussen komt Sipowicz erachter dat een voormalige misbruikzaak waaraan hij had gewerkt, is geëscaleerd tot moord; en de relatie van Medavoy en Donna wordt onthuld nadat luitenant Fancy hen op heterdaad betrapt, wat ertoe leidt dat Fancy het politiebureau waarschuwt voor interoffice-relaties.
Dead and Gone
Kelly's toekomst bij het korps wordt beslist als hij de dood onderzoekt van een 18 maanden oude baby die tijdens een drive-by werd neergeschoten terwijl hij in een auto reed die werd bestuurd door Duane Rollins. Hoewel iedereen gelooft dat de daad willekeurig was, gelooft Kelly dat Rollins het beoogde doelwit was. Ondertussen vindt Sipowicz het lichaam van een agent en moet hij doorgaan met het omgaan met zowel zijn verplichtingen jegens de Anonieme Alcoholisten als zijn gevoelens voor Sylvia Costas.
Simone Says
Bij afwezigheid van Kelly voegt rechercheur Bobby Simone zich bij het korps en krijgt hij de opdracht om samen met Sipowicz te werken aan een zaak over de moord op de zoon van een maffialid. Later op het politiebureau bedreigt haar vriend, rechercheur Jimmy Abruzzo, rechercheur Lesniak met een pistool; en een vrouw beweert dat haar man haar 14-jarige dochter seksueel misbruikt.
The Final Adjustment
De vrouw van een chiropractor wordt vermoord aangetroffen en Simone en Sipowicz ontdekken dat de chiropractor, dr. Peter Shennon, een affaire had met zijn secretaris, Judith Krasky, waardoor alle verdenkingen op hem gericht zijn. Ondertussen wordt Martinez, terwijl hij voor een beveiligingsbedrijf werkt, verliefd op Leticia Beltran, een studente die hij moet beschermen. Later brengt een vrouw, Christine Williamson, Simone een pistool waarmee ze haar 11-jarige zoon aan het spelen was.
Double Abandando
Een 11-jarige jongen geeft toe dat hij een Spaanse leerling heeft vermoord midden in een bendeoorlog op zijn basisschool, maar Simone vermoedt dat de jongen de schuld voor iemand op zich neemt. Wanneer een damesman, Eddie Reyna, ontdekt dat hij HIV-positief is, wordt hij het doelwit van een van zijn voormalige geliefden die hij heeft besmet met de ziekte. Ondertussen komt Donna's zus, Dana, op bezoek in de stad, wat een breuk veroorzaakt tussen Donna en Medavoy.
You Bet Your Life
Sipowicz en Simone worden toegewezen aan de zaak van een zwangere vrouw die werd vermoord en de enige verkoolde overblijfselen blijven over, wat betekent dat er weinig aanwijzingen zijn voor de rechercheurs. Ondertussen maakt Sipowicz zich steeds meer zorgen als een goede vriend, Dan Breen, zwaar wordt geslagen door zijn verstandelijk gehandicapte zoon Danny.
Don We Now Our Gay Apparel
Simone en Sipowicz onderzoeken de moord op een homobar-eigenaar en hebben transseksueel Candace La Rue als materiële getuige. Dan Breen besluit zijn geestelijk gestoorde zoon Danny te bezoeken, ondanks dat Sipowicz hem heeft gewaarschuwd dit niet te doen. Elders onderzoekt Medavoy een waarzeggerij-zwendel nadat een vrouw haar spaargeld is afhandig gemaakt; en de vrouw van luitenant Fancy gaat bevallen.
In the Butt, Bob
Rechercheur Soloman probeert zijn status te gebruiken om een zaak van rechercheur Simone te stelen nadat Simone een beruchte seriemoordenaar, Putnam, heeft gearresteerd. Ondertussen zorgt commandant Haverill ervoor dat luitenant Fancy liegt over een zaak waarbij een misdaadheer betrokken is; Lesniak gaat achter een flitser aan; Sipowicz stelt Sylvia Costas opnieuw voor; en Benita Alden, een verslaggever, flirt met Simone.
Vishy-Vashy-Vinny
Simone en Sipowicz volgen het spoor van de seriemoordenaar 'Webster Dictionary', hoewel de politiek van het bureau hun tol eist van de zaak. Ondertussen gebruikt Sipowicz Vinnie Greco als informant om een bankoverval te stoppen; en luitenant Fancy roept de hulp van Greco in om wraak te nemen op commandant Haverill.
Large Mouth Bass
De rechercheurs onderzoeken de brute moord op een jonge vrouw. Hun onderzoek leidt tot één hoofdverdachte: Derrick Cobb, de voormalige stiefvader van het meisje. Simone maakt zich zorgen dat een van zijn goede vrienden, Raymond diSalvo, betrokken is geraakt bij de drugshandel in een dansclub. Lesniak onderzoekt oplichter Mac McClellan.
Travels with Andy
Drie fastfoodmedewerkers worden in executiestijl vermoord. Terwijl Simone en Sipowicz de moorden onderzoeken, onderzoeken Martinez en Lesniak de poging tot verkrachting van een oudere vrouw. Ondertussen hebben Sipowicz en Sylvia Costas meningsverschillen als het gaat om het plannen van hun bruiloft; en Martinez wordt jaloers als Lesniak luncht met een oude vriend, Dr. Druzinski.
A Murder with Teeth in It
Simone en Sipowicz onderzoeken de dood van een pooier, maar al het bewijsmateriaal dat ze vinden wijst op een van hen, Jerry McCabe. De constante jaloezie van Medavoy zorgt ervoor dat Donna hun relatie heroverweegt en Simone begint zich zorgen te maken dat Benita Alden hem gebruikt voor haar carrièrewinst.
Bombs Away
Simone en Sipowicz krijgen de opdracht onderzoek te doen naar Vartan Illiescu, een immigrant die ervan verdacht wordt een terrorist te zijn. Een onbekende persoon vermoordt George Putnam, een seriemoordenaar, uit wraak voordat hij voor de rechtbank kan worden berecht. Ondertussen brokkelt de relatie tussen Medavoy en Donna af nadat Medavoy advies krijgt van Dana.
UnAmerican Graffiti
Simone en Sipowicz worden betrokken bij de zaak van een tiener die bekend staat om zijn graffitiwerk en die op brute wijze werd vermoord. Ondertussen blijft Donna nadenken over haar relatie Medavoy; en Sylvia wordt overvallen, wat ertoe leidt dat een diep geheim aan Sipowicz wordt onthuld.
Dirty Socks
Simone moet Joyce Novak, een getuige in een dubbele moordzaak, overtuigen om te getuigen. Sipowicz krijgt de opdracht om de moord te onderzoeken op een oudere vrouw die eigenaar was van een snoepwinkel waar hij werkte toen hij opgroeide.
Innuendo
Een man begint met schieten en doodt een serveerster, twee agenten en drie andere burgers voordat hij wordt aangehouden. Ondertussen spreekt luitenant Fancy namens Reggie nadat Reggie de confrontatie heeft aangegaan met sergeant. MacNamara.
Boxer Rebellion
Simone voelt zich aangetrokken tot een undercoveragent, Diane Russell, terwijl ze samenwerken om een brandstichter te arresteren. Sipowicz raakt persoonlijk betrokken bij een zaak nadat een vrouw die hij heeft overtuigd om in een zaak te getuigen, wordt vermoord. Martinez en Lt. Fancy nemen het tegen elkaar op tijdens het jaarlijkse afdelingsbokstoernooi.
The Bookie and the Kooky Cookie
Hulp komt uit onverwachte hoek als Sipowicz en Simone de moord op een bookmaker onderzoeken. Joyce Novak, getuige van een moord, beschuldigt Simone van seksuele intimidatie. Ondertussen gaan Sylvia en Sipowicz naar religieuze counseling om zich voor te bereiden op hun aanstaande huwelijk.'
The Bank Dick
Een ziek kind wordt de ontbrekende schakel in een serieverkrachtingszaak die Simone en Sipowicz onderzoeken. Simone verdenkt Russell ervan een ernstig probleem te verdoezelen; Medavoy overweegt om weer bij elkaar te komen met zijn vrouw met wie hij gescheiden is; en Irvin vraagt Simone om hulp als politieagenten hem en zijn geliefde aanvallen.
A.D.A. Sipowicz
Sipowicz probeert een bekentenis te krijgen en maakt gebruik van een identiteitsverwisseling. De broer van luitenant Fancy wordt valselijk beschuldigd van het aannemen van steekpenningen en Simone kan de waarheid achter de misdaad ontdekken. Russells schijnbare kater resulteert bijna in een gevaarlijke situatie tijdens een sweep. Later organiseert het politiebureau een vrijgezellenfeest voor Sipowicz, die merkbaar last heeft van kriebels vóór het huwelijk.